Bon, la dernière fois on a vu de grosses généralités sur les virus. Parlons maintenant d'une famille de virus spécifique, au hasard, les #coronavirus (CoV).
Thread:

Déjà, première chose, les coronavirus sont une famille de virus.
Le #SARSCoV2, responsable de la #COVID19 , est l'un des virus de cette famille.
Alors, qu'est ce qu'on peut dire sur eux?

Les coronavirus sont des virus à ARN monocaténaire (avec un seul brin), enveloppés par une capside et possédant un péplomere.

Bon, ça peut paraître un peu obscur comme ça, mais on va détailler tranquillement.

D'abord, le péplomere. Il s'agit de la couronne de protéines qui entoure les coronavirus et leurs donne cette forme particulière.
Il s'agit de protéines S , ou spike.
C'est une glycoprotéine prenant la forme d'une pique (donc spike en anglais) retrouvée sur l'enveloppe.

Les péplomeres ne sont pas spécifiques aux coronavirus, on en retrouve par exemple sur des virus responsables de la grippe.
C'est leur disposition en forme de couronne qui donne leur nom aux coronavirus.

On reparlera un peu plus tard de ces petites piques de protéines S.

À l'intérieur de l'enveloppe, on trouve une capside, qui renferme le génome. Pour les coronavirus : de l'ARN.

Alors la, je suis désolé, mais il va falloir qu'on détail un peu.

L'ARN, qu'est ce que c'est ?

L'Acide ribonucléique (ARN), est un acide nucléique présent dans quasiment l'ensemble du vivant. Proche de l'ADN, ce n'est néanmoins pas la même chose.
Généralement, l'ARN est synthétisé à partir d'une matrice de l'ADN. C'est une copie, utilisée pour fabriquer des protéines.

C'est @Hedge_Doc je crois qui avait une analogie pour expliquer ça. Je vais lui piquer.
Imaginez que l'ADN, c'est le livre de recettes. L'ARN serait une photocopie d'une page de ce livre.
On met cette copie dans le four (un ribosome), et vous avez votre gâteau (la protéine)

Donc, l'ARN, composé de nucléotides, est une séquence génétique issue de l'ADN, qui va servir de messager (ARNm ou ARN messager) et sera utilisé comme intermédiaire par les cellules pour la synthèse des protéines, via les ribosomes.
C'est un processus normal du vivant.

L'ARN est donc le moyen de stocker le matériel génétique des coronavirus. Gardez bien ça en tête, on en reparlera quand on évoquera la replication virale du sars-cov2.

Les spike aussi vous mettez ça de côté dans votre tête. Pareil, on en reparlera avec le sars-cov2.

En attendant, revenons-en aux coronavirus en général.

Le monde à découvert le mot coronavirus cette année, mais ils sont connus depuis longtemps des scientifiques.
Il en existerait plus de 5000 différents.
Quatre d'entre eux, le HCoV 229E, le HCoV NL63, le HCoV OC43 et le HCoV HKU1 sont responsables de 15% à 30%... des rhumes.

Les coronavirus sont très à l'aise chez les vertébrés à sang chaud, comme les chauve-souris par exemple.
Rien que chez cet animal, 500 type de CoV ont été identifié.

Gardons cette info de côté.

Comme vous le savez maintenant, le génome du sars-cov2 est contenu dans de l'ARN.
Il se duplique par copie.
Seulement parfois, la copie n'est pas parfaite, et des coquilles se glissent d'une copie à l'autre.
Le virus mute.

MAIS !... mais cela reste des copies.
Copies dont certains mots sont toujours la depuis l'origine.
On peut donc "tracer" le virus, savoir comment il a progresser sur les territoires en fonction de ses mutations.

Autre élément intéressant, on peut savoir si le virus est d'origine humaine.
En fonction du génome, dans lequel on retrouve des éléments "naturels", de la disposition des spike, mais aussi en étudiant les autres types de coronavirus:

Si un labo avait créé le virus, on retrouverait des traces d'autres coronavirus combinés dans le génome. Ce qui n'est pas le cas.
Une étude intéressante sur le sujet : https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9?fbclid=IwAR1Nj6E-XsU_N6IrFN1m9gCT-Q7app0iO2eUpN5x7OSi-l_q6c1LBx8-N24

Ça, c'était l'aparté pour les complotistes .

On a donc vu que les coronavirus étaient fréquents.
Ils sont responsables de beaucoup des rhumes que nous subissont.
7 coronavirus sont pathogènes pour l'homme.
J'en ai évoqué 4, il en reste donc 3.
Tous apparus après 2000.

1-Le SARS-CoV:
Provoquant le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) .
Apparu en Chine en 2002, il provoque une épidémie en 2003.
Plus de 8000 infectés, 774 morts.
Fièvre, dyspnée, toux, dysphasie, lymphopénie (carence en lymphocytes, cellules du système immunitaire)

Pneumopathie sévère et j'en passe.
Avec une létalité de près de 10%, l'OMS à pris la chose très au sérieux.
Par chance, l'incubation n'est pas très longue, et les formes asymptomatiques relativement rares. Il sera donc vite endigué.
Pneumonie chez un patient atteint de SRAS:

2- Le MERS-CoV:
Agent pathogène du syndrome respiratoire du moyen Orient.
Decouvert en 2012.
361 infectés, 107 décès.
Celui-ci, il n'est pas sympa du tout.
Pneumopathie aigue, insuffisance rénale, et bien souvent : la mort.

La mise en place d'un dispositif de veille sanitaire très rapide, et l'identification du virus dans des délais très courts évitent une pandémie.
On a pas envie qu'il revienne, croyez moi.

3-Le SARS-CoV2 :
Responsable du covid 19, on ne le présente plus, c'est la superstar des virus.
À ce jour, environ 30 millions d'infectés, et quasiment 1 million de décès dans le monde.
Il aura arrêté l'activité humaine pendant des semaines, et l'épidémie est encore active.

Je ne vais pas détailler ici le sars-cov2; ça sera le prochain thread. Ici, il était question de présenter cette belle famille qu'est les coronavirus, c'est chose faite.
La prochaine fois : le sars-cov2, des histoires de replication virale, et du spike encore.